Le Ragionamento quinto décrit et justifie la nouvelle numérotation des modes (en partant de do, plutôt que de ré), utilisée ensuite notamment dans la 2e édition des Istitutioni (voir 1558). Les justifications sont notamment que le système syntonique diatonique (zarlinien) est calculé à partir du do et que la nouvelle numérotation situe les modes dans l'ordre de l'hexacorde. Zarlino modifie aussi les noms donnés aux modes. Sa terminologie n'est qu'assez rarement utilisée (même par lui-même), mais se trouve néanmoins chez Mersenne et chez Fux.